アラニンとチロシンからなるジペプチドの考えられる構造式を全て記せ。ただし、
アラニンとチロシンの構造式は下図とし、アミノ酸の立体構造は考えなくてよい。またアミノ酸間の結合を何というか？
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答
以下の図２つ。ペプチド結合。
アミノ酸はＮＨ２の部分とＣＯＯＨの部分からH20がとれて脱水縮合（縮合重合）されてつながっていく。この結合をペプチド結合という。
Ｃ＝Ｏ
｜
Ｎ−Ｈ
である。
画面では省略しているが、ペプチド結合１つができる時に1分子水ができている。
そして重要なのでどちらのＮＨ２、ＣＯＯＨが結合に加わり、どちらが加わらないかは自由である。
ＮＨ２が残される側をＮ末端（アミノ基末端）、ＣＯＯＨが残される側をＣ末端（カルボキシ（ル）基末端）といい、タンパク質の正式な記述の方向は
Ｎ末端→Ｃ末端側となる。
よって
（Ｎ末端）ーアラニンーチロシンー（Ｃ末端）
（Ｎ末端）−チロシンーアラニンー（Ｃ末端）
の２つがある。
なおこの２ペプチド・３ペプチドの合成の化学式は生物でも化学での出題される。アミノ酸の式から慎重にＨ２０をはずしていく作業をすれば間違えないはずであるが、Ｃの数を１つ減らしてしまう間違いをする人が多い。
上図のように
Ｃ
‖
Ｏ
の右側（横側の主鎖）はＣが「２つ」（中心炭素とカルボキシル基の炭素）続いているのが正解なので
Ｃを「１つ」にしてしまう間違いを避けよう。
なおＣＯＯＨは「カルボキシル基」と書いてきたが、学問的には「カルボキシ基」の表記が推奨されている。入試では両方許される。