さて、今日は、４年前のノーベル医学生理学賞の大隅良典教授のオートファジーを
「タンパク質リサイクル」の１つの方法であることを確認しながらおさえましょう。大きな図をできるだけスマホなどで読める程度に圧縮しました。問題形式ではなく、図を使った解説です。
細胞内では①リボソーム（緑）で合成されたタンパク質（赤）は②分子やペロンできれいに折りたたまれ立体構造を形成する（フォールディング）。しかし、それに失敗したものは③Ｕｂ（ユビキチン）という「不良品ラベル」を付けられ、それが付いたものは④プロテアソームで分解され、短いペプチドに切断され、最終的にアミノ酸に分解再利用される。
（ユビキチン・プロテアソーム系）
①リボソーム後、⑤小胞体に送り込まれたタンパク質は、小胞体やゴルジ体⑥で糖付加などされ、⑦分泌小胞で細胞外に分泌される。（エキソサートーシス）
逆に細胞外の成分（ヒトでは体液などを浮遊しているタンパク質など）を⑨エンドサートーシス（細胞内に取り込む）や細胞外の構造物を取り込むファゴサイトーシス（⑩）という作用もある。
これらはもともとはゴルジ体⑥由来の膜が分泌小胞とならずに⑧リソソームとなったものに取り込まれ、加水分解酵素で、タンパク質ならばアミノ酸にバラバラにされていく。
大隅良典教授の研究したオートファジー（自食）とは、このリソソームによる分解の流れに合流するもので、もともとは細胞膜由来の膜にミトコンドリアや不要な細胞内成分を取り込み自食胞（オートファゴソーム）をつくる。これがリソソーム（⑧）と合体に、やはりタンパク質はアミノ酸まで分解してリサイクルされる。
大隅教授は酵母菌（真核生物・単細胞）をもとにこれを明らかにした。これは人を含む真核生物に共通のしくみである。